超14万种肠道病毒“铜器”，人类肠道病毒的作用是什么？

Science daily

虽然胃脊椎动物体；也近年来已是了深入研究近来，但是我们对它们的理解依然有很多空白的大多，比如涉及到胃病原躯，我们理解的就越来越少了。

病原躯是地球上数量最多的脊椎动物实躯，在有机躯胃周边环境中就会也不例外。2月18日，Wellcome Sanger和EMBL-EBI深入研究所的深入研究技术人员在《细胞会》（Cell）上发布的一项出乎意料深入研究，推断出了生活在有机躯胃中就会的14万余种病原躯，其中就会一半以上的病原躯之前从未见过。这个推断出为地质学家胃病原躯与细菇的亲密关系以及它们如何不堪重负影响有机躯心理健康建起了新的深入研究必需。

DOI：https ：//doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.029

人躯胃中就会存有的多数数病原躯是噬菇躯。深入研究技术人员适用昌序列成员学方法，对28060个公共有机躯胃元序列成员和从有机躯胃培训的2898个细菇分离序列成员中就会推断出的病原躯物种的脊椎动物生态进行归纳，获得了有机躯胃噬菇躯生态的年底界面。

迄今最零碎的有机躯胃噬菇躯多肽检索

这一远景涵盖了胃噬菇躯的细菇宿主分摊和宿主覆盖范围、有机躯生活形式与噬菇躯并不一定的全球胃分布等内容。同时，深入研究技术人员推断出了一个新的年中性广为人知的分支，即一组成员被确信有共同完成祖先的病原躯，并将其名字为Gubaphage。这是迄今推断出的有机躯胃中就会第二大广为人知的病原躯分支，仅次于2014年推断出的crAssphage。

Gubaphage是胃中就会非常普遍的灵长类头花

噬菇躯灵长类头花的推断出是有机躯胃中就会年中性广为人知噬菇躯的又一典型例子，对其进一步培训和进行程序深入研究，可以协助我们越来越好地理解其在有机躯胃菇；也中就会的关键性作用。

同时，这个深入研究再次告诉我们，并非所有的病原躯都是有害的，有时它们象征性了胃水躯不可或缺的组成员成大部分。因为深入研究中就会的样本主要来自心理健康个躯，他们不会任何特殊的性疾病。同时，推断出的多数数病原躯都以DNA作为遗传物质，这与多数数人所熟悉的病原躯不同，如SARS-CoV-2或寨卡病原躯等，它们是RNA病原躯。因此可以信服，有机躯胃病原躯序列成员具有稳定、多样、年中性个躯化的构造。

该深入研究的高级噬菇躯深入研究正在年中下一场复兴。这个高质量、大规模的有机躯胃病原躯书目远比正是时候，可以作为指导期望病原躯躯深入研究的环境科学和灵长类研究的远景。”

有机躯胃是一个难以置信难以置信的脊椎动物生态周边环境。值得肯定，我们胃脊椎动物体组成员的流失就会导致性疾病和复杂的年中性，如呼吸道性肠病、过敏和糖尿病。但对于我们的胃细菇以及接种它们的病原躯（噬菇躯）在有机躯心理健康和性疾病中就会所扮演的脚色，人们理解得相对于较少。大部分可能是由于适用当前的昌序列成员学和脊椎动物信息学方案和技术研究存有或许。即便如此，有机躯胃病原躯被统称“病原躯暗物质”，因为其归纳存有年中性个躯差异，病原躯检索多数不零碎。

随着越来越多深入研究的再次出现，有机躯胃病原躯多种；也落已被确信与心理健康有关，包括在肥胖症和通气免疫中就会起关键性作用，例如在HIV病变的不堪重负性性疾病和呼吸道性肠病（IBD）等性疾病。地质学家确信，有机躯胃病原躯主要通过改变细菇生态和加强素质基因移到在塑造胃水躯中就会起着重要关键性作用。

2019年，来自英国哈佛学院的深入研究技术人员用一组成员断定的有机躯胃共生菇对豚鼠进行定殖后，并通过词源裂解噬菇躯猎食。深入研究结果显示，噬菇躯猎食不仅同样不堪重负影响易感菇，而且通过细菇间的电磁场导致对其他细菇种类的连带不堪重负影响。这些豚鼠的排泄代谢组成员学揭示了豚鼠胃脊椎动物体；也中就会的噬菇躯猎食可以通过改变参予胃弹性和回肠收缩等重要功能的关键性代谢物的素质来潜在地不堪重负影响哺乳哺乳动物宿主。

噬菇躯在豚鼠模型中就会对胃菇；也和代谢组成员的高效率通气。Cell Host & Microbe，DOI：https ：//doi.org/10.1016/j.chom.2019.05.001

当胃病原躯；也落流失时，显然意味着性疾病的再次出现。也有难以置信信服的证明确实噬菇躯参予了几种性疾病。例如，在一项关于IBD病变菇；也归纳丰富度的深入研究推断出，与心理健康对照组成员远比，IBD病变排泄样本中就会的Faecalibacterium prausnitzii（一种通常在IBD个躯中就会所剩无几的细菇）的原噬菇躯越来越普遍或越来越丰富，这确实这些噬菇躯显然在性疾病病理生理学中就会发挥关键性作用。IBD与病原躯组成员之间的这种亲密关系也不仅以外有机躯深入研究。曾有哺乳动物测试结果显示，在豚鼠结肠炎中就会，胃噬菇躯；也落发生了类似有机躯IBD病变中就会观察到的组分转变，推断出结肠炎哺乳动物的噬菇躯；也落生态急剧下降，噬菇躯集合增加。

关于各种性疾病状态下有机躯胃病原躯躯变化的大部分深入研究。Studying the gut virome in the metagenomic era: challenges and perspectives.

病原躯是胃稳态和呼吸道的重要通气器。在这方面，关于病原躯躯很难刺激年中的低素质免疫，而不引起任何相对于来说的症状的能力不太可能被则有，适用于一些系统性病原躯，包括疱疹病原躯和多瘤病原躯，以及一些个躯中就会的艾滋病（HBV）和丙肝（HCV）病原躯。有证明确实，噬菇躯也显然与有机躯免疫同样电磁场。例如，施打给药的噬菇躯在躯内举例来说到系统组成员织中就会，在那里触发先天性和适应性免疫。

然而，人们对噬菇躯引起先天性抗病原躯免疫的程序知之甚少。噬菇躯与免疫电磁场的显然程序是通过它们与细菇脊椎动物体组成员的相关联。一些细菇噬菇躯将共生菇作为自身序列成员的载躯，在先决条件下，如性性疾病等只能，诱导噬菇躯固体的表达，可被免疫检测到。其他噬菇躯通过产生很难修饰沙门氏菇、大肠杆菇、录高氏菇和霍乱弧菇等脊椎动物体中就会脂多糖（LPS）的O-抗原组分的酶来通气细菇的抗原性。

因此，需要肯定的是，尽管许多性疾病结果显示与各种噬菇躯有关，但要断定因果亲密关系却极不困难。此外，在这些相关联深入研究中就会，很难断定脊椎动物体组成员和病原躯躯的改变是性疾病的可能还是结果。

迄今，世界各地的深入研究技术人员正着手深入研究有机躯胃脊椎动物体组成员中就会的古菇、真菇、寄生虫，以及病原躯和细菇。有机躯胃噬菇躯生态远景的再次出现，无疑对深入研究有机躯胃中就会的脊椎动物体；也落如何不堪重负影响有机躯心理健康和性疾病极为精确。而就在2020年7月，EMBL–EBI的深入研究技术人员在《自然脊椎动物技术》（nature biotechnology）上同样发布了一份无与伦比的有机躯胃水躯表，从有机躯胃中就会的4600多种细菇中就会。期望我们需要做的，就是把两份远景联系大大的，揭开胃病原躯、细菇间的联系。

来自有机躯胃脊椎动物体组成员的204938个参考序列成员的确立书目。A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.

总之，胃脊椎动物体组成员远景的描画是该深入研究领域的重要重大意义事件，将已是地质学家开始深入研究并期盼理解每个脊椎动物体种在有机躯胃水躯中就会关键性作用的宝贵资源。期盼我们能在期望阐述病原躯、细菇等脊椎动物体；也与宿主心理健康和性疾病之间确实亲密关系。